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【慧眼识菌】一株CO2依赖性大肠埃希菌的检出

2021-12-22 19:00

作者 吴成

京港感染论坛

十年京港,逐梦感染病精准诊疗


大肠埃希菌是引起尿路感染常见的细菌之一,但嗜CO2大肠埃希菌较为罕见1-3]。2021年9月7日,本院从一名女性患者尿液中分离出一株大肠埃希菌,发现此菌株在药敏板上不生长,经过反复实验证实为一株CO2依赖性大肠埃希菌,现报道如下。

1.病例摘要

患者,女,64岁。因间断发热10余天,于2021年9月6日来我院就诊。患者于10余天前无明显诱因间断出现发热,以夜间发热为主,最高体温38度。伴尿频、纳差、全身乏力,无咳嗽咳痰、无咽痛、无尿急尿痛。

实验室检查:

血常规:WBC:12.8*109/L,N:10.8*109/L.

尿常规:WBC:3+,RBC:1+,PRO:3+

白介素-6: 13.34pg/ml, 

超敏C反应蛋白:CRP <0.5ug/ml,

降钙素原:PCT <0.5 ug/L

彩超:左肾切除,右肾输尿管、膀胱声像图未见异常。

CT:   两肺未见明显异常

初步诊断:发热待查,泌尿系感染?

医嘱:完善相关检查(包括尿培养)

2.培养鉴定及药敏试验

2.1培养及鉴定

9月7日 微生物室接收到患者中段尿标本,取10ul接种到哥伦比亚血琼脂平皿上,置35度5%CO2环境中孵育。

9月8日 经24小时孵育,培养出革兰氏阴性杆菌,经梅里埃质谱仪MS鉴定为大肠埃希菌(菌株a)。菌量>10万cfu/ml 。

2.2药敏试验

2.2.1首次药敏试验

9月8日  按照Aris-2x全自动药敏仪操作规程进行菌液的配制、稀释、加样, 然后封板,放入Aris-2x仪器中进行孵育。9月9日 仪器自动读板没有结果,取出药敏板,发现整个药敏板无菌生长,阳性对照孔也无菌生长。

考虑可能是操作不当的原因所造成,第二次由另外一位检验师严格按操作规程进行菌液的配制、稀释、加样,然后置于仪器中孵育。9月10日 仪器读板再次失败,整个药敏板无菌生长,阳性对照孔无菌生长。经过反复思考,再次重复菌液配制的过程:把“菌株a”用生理盐水配制成0.5麦氏的菌液(菌液1); 取(菌液1)10ul加入11ml的肉汤中进行稀释(菌液2)。然后把菌液1和菌液2分别接种到哥伦比亚血琼脂平皿上,放于35度5%CO2环境中孵育。9月11日,观察发现转种在哥伦比亚血琼脂平皿上的菌液1和菌液2均生长良好。

2.2.2二次药敏试验

菌株在生理盐水和肉汤中生长良好,为什么在药敏板上不生长?是没有放CO2环境中吗?于是把“菌株a” 再次按照药敏操作流程进行菌液的配制、稀释、加样(同时加样到A、B两块药敏板进行生长对照),均不封板。A药敏板放仪器中孵育,B药敏板放于35度5%CO2环境中孵育。9月12日, 孵育24小时后,仪器中的A药敏板依然读不出结果,阳性对照无菌生长。从CO2培养箱中取出B板,肉眼观察发现:B板阳性对照孔生长良好。 

为了确认此菌株对CO2依赖性,将菌株a和ATCC 8739同时接种在a, b两个血琼脂平皿上进行对照生长,a平皿放在5%CO2环境中孵育,b平皿放在普通培养箱内孵育。

9月13日 观察两块平皿的生长情况:a平皿上两种菌株均生长良好;b平皿上左边无菌生长(菌株a),而右边菌株(ATCC8739)生长良好。

a   菌株a /8739(CO2环境)

b   菌株a/ 8739 (普通环境)

2.3试验结论

通过以上实验,证明“菌株a”为一株CO2依赖性大肠埃希菌。此菌株的分离培养需要5%-10%CO2,在哥伦比亚血琼脂平皿上形成圆形、光滑、湿润的菌落。

3.诊疗过程

2021年9月6日,患者因发热,头痛,尿频,乏力来我院就诊,门诊以“发热待查”收治入院。

2021年9月7日,行尿培养

2021年9月9日,我实验室发出尿培养报告“培养出大肠埃希菌 计数>10万cfu/ml”.根据培养结果,临床经验性使用头孢哌酮/舒巴坦进行抗感染治疗。2021年9月12日,患者体温正常,但仍感发热,无尿频尿急。

血常规:WBC:7.8G,PCT正常,CRP正常。

尿常规:WBC1+,RBC阴性,PRO:1+

医嘱不变,继续使用头孢哌酮/舒巴坦进行抗感染治疗

2021年9月14日,患者无发热,无尿频尿急,一般状况良好,准予出院。

4.讨论

此株从尿液中分离的CO2依赖性大肠埃希菌,在临床表现及耐药性方面与普通大肠埃希菌相似,但此菌株的生长需要一定浓度的CO2,因此分离培养和药敏生长试验均需在CO2环境中进行。通常情况下实验室没有将尿液培养基放入 CO2 环境中孵育,或者有些小型实验室没有 CO2 培养箱,导致此菌株检出率降低。所以,要求原代培养使用 CO2培养箱可减少该类细菌的漏检,在无CO2 培养箱的情况下建议处理此类培养标本要有一个初步革兰染色涂片,当革兰染色与培养结果不一致,需要考虑细菌生长的环境,避免漏检或假阴性培养。同样,药敏板一般都是放在普通环境中孵育,当药敏试验失败,就需要考虑菌株的生长环境是否合适,譬如是否需要CO2

另外,试验发现此菌株可在克氏双糖管生长: CO2依赖性大肠埃希菌在微氧或厌氧环境下,能依靠分解环境中的糖类所产生的CO2供自身生长,当CO2不再产生,菌株就会停止生长。这一生长特性在环境学研究方面可能有一定的应用价值。


参考文献(上下滑动)

[1] Tena D,Gonzlez-Praetorius A,Sez-Nieto JA,et al. Urinary tract infection caused by capnophilic Escherichia coli[J]. Emerg Infect Dis,2008,14( 7) : 1163-1164

[2] Lu W,Chang K,Deng S,et al. Isolation of a capnophilic Escherichia coli strain from an empyemic patient[J]. Diagn Microbiol InfectDis,2012,73( 3) : 291-292

[3] 张峰领,黎 敏,鲁卫平.自假性动脉瘤患者术后伤口分泌物中分离1 株嗜 CO2 大肠埃希菌[J].临床检验杂志,2014(5):400


作者简介


吴成

1996年毕业于湖北省药检专科学校医学检验专业。现任湖北省随州市广水市第一人民医院检验科副主任技师,微生物专业组组长。从事微生物专业多年,2015年和2017年获随州市科技进步三等奖两次;参与院内科研项目两项;发表专业论文三篇。2018年在华中科技大学附属同济医院进修半年。


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作者|吴成

审校|王占伟