a、病毒按照频率递减列出[110]

b、现在已有若干FDA核准的NAAT平台。它们的不同在于：批准的所需标本，分析物检测的范围。读者需要与实验室确认可用性及检测性能特征包括特定局限性。

c、快速呼吸道病毒检测抗原缺乏灵敏度且特异度取决于试剂盒。一项关于快速流感抗原检测的荟萃分析显示合并灵敏度为62.3%，合并特异度为98.2%。可以考虑仅作为筛查试验。阴性结果至少需要采用另外一种方法进行复核。标本质量对于优化检测至关重要。

d、标本类型取决于目标病毒种类。大体来说，咽拭子是最不理想标本。收集标本后使用VTM或无菌容器置于干冰进行转运可以保护细胞。

e、目前有一些FDA核准的试剂盒可用。两个试剂盒为复合多重通道，含肺炎支原体和肺炎衣原体作为呼吸复合通道的一部分。有一个试剂盒单独检测肺炎支原体。实验室可用性是有差异的，临床医生需要与实验室确认可用标本来源，采集及转运与检测特性，回报时间。一般而言，避免藻酸钙拭子以及mini-tipped拭子进行核酸扩增检测。

f、对于非菌血症的肺炎链球菌性肺炎灵敏度为52%-78%；菌血症阳性的肺炎链球菌肺炎灵敏度为80%-86%；成年人特异度＞90%。不适用于儿童。有研究显示对于鼻咽（部）定植儿童及慢性结构性肺病但无肺炎证据的成年人有21-54%假阳性率。[128, 131].

h、床旁接种很理想但是很少能实现。一些转运培养基可以接受，包括含酪氨酸水解物(Casamino acid solution)的Amies转运培养基及Regan Lowe转运培养基 (Hardy Diagnostics) [132].

a、对于非菌血症的肺炎链球菌性肺炎灵敏度为52%-78%；菌血症阳性的肺炎链球菌肺炎灵敏度为80%-86%；成年人特异度＞90%。不适用于儿童。有研究显示对于鼻咽（部）定植儿童及慢性结构性肺病但无肺炎证据的成年人有21-54%假阳性率。[128, 131].

b、目前有一些FDA核准的分析可用。两个试剂盒为复合多重检测（multiplex panel），含肺炎支原体和肺炎衣原体作为呼吸检测（respiratory panel）的一部分。有一项测试单独检测肺炎支原体，实验室可用性是有差异的，临床医生需要与实验室确认可用标本来源，采集及转运与检测特性，以及检验报告时限。大体来说，避免藻酸钙拭子以及mini-tipped拭子进行核酸扩增检测。

c、现在已有若干FDA核准的NAAT平台。它们的不同在于：认可标本要求，分析物检测的范围。读者需要与实验室确认可用性及检测特征包括特定局限性。

d、涂片阴性，培养阳性标本NAAT的敏感度仅为50%-80%（NAATs诊断结核的更新指南Morb Mortal Wkly Rept (MMWR) 2009；58:7–10)。

宁按：上一版没有这一条注释。而参考文献排版不同，显系排版后补。

a、厌氧培养仅在标本为通过保护性毛刷或导管获得时进行，并且需要通过厌氧转运容器或将毛刷置于1ml预还原肉汤中进行转运。宁按：保护性插管抽吸可以做厌氧培养。

b、对于非菌血症的肺炎链球菌性肺炎灵敏度为52%-78%；菌血症阳性的肺炎链球菌肺炎灵敏度为80%-86%；成年人特异度＞90%。不适用于儿童。有研究显示对于鼻咽（部）定植儿童及慢性结构性肺病但无肺炎证据的成年人有21-54%假阳性率。[128, 131].

a、目前没有FDA批准的试剂盒。实际应用的试剂因实验室不同而异。提供者应该核实最佳标本源、方法学特征和周转时间。

b、这些检查的方法学特征综述见文献[133,134]。

c、可能会和其他地方性真菌有交叉反应。

a、仅适于小于8岁的儿童；常常被称为“令人窒息的痰（gag sputum）”。

b、目前已有数个NAAT平台获得美国FDA批准，它们的不同之处在于：批准的试样要求，分析物检测的范围。读者需要汇同这些实验室核定试验可行性和性能特点包括特定局限性。

a、目前没有FDA核准的方法，既有方法因实验室而异，提供者需要汇同实验室核定最佳标本来源，性能特点以及周转时间。

b、在适当的临床背景下，血清或BALβ-D-葡聚糖水平的上升高度提示耶氏肺孢子菌感染，阳性结果应该由针对病原体的试验确认，例如NAAT或DAF。

c、此来源的标本FDA仅批准用于半乳糖苷酶检测。