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【规范与指南】IDSA/ASM2018临床微生物学检查应用指南(三)

2018-12-02 15:57

作者


IDSA是美国感染性疾病学会;ASM是美国微生物学学会。两个学会在2013年发布过一个大型微生物学指南。出版信息如下:

Baron EJ, Miller JM, Weinstein MP, Richter SS, Gilligan PH, Thomson RB Jr, Bourbeau P, Carroll KC, Kehl SC, Dunne WM, Robinson-Dunn B, Schwartzman JD, Chapin KC, Snyder JW, Forbes BA, Patel R, Rosenblatt JE, Pritt BS. A Guide to Utilization of the Microbiology Laboratory for Diagnosis of Infectious Diseases: 2013 Recommendations by the Infectious Diseases Society of America (IDSA) and the American Society for Microbiology (ASM). Clin Infect Dis. 2013 Aug;57(4):e22-e121.

两个学会于前不久,发布了该指南的升级版。作者也有所调整。详见IDSA官网指南板块(www.idsociety.org)。题目变化不大。如下:

A Guide to Utilization of the Microbiology Laboratory for Diagnosis of Infectious Diseases: 2018 Update by the Infectious Diseases Society of America and the American Society for Microbiology.


续上期:【规范与指南】IDSA/ASM2018临床微生物学检查应用指南(二)

第一部分详见京港感染论坛2018.7.18微信文章

【规范与指南】IDSA/ASM2018临床微生物学检查应用指南





表10




硬膜内积脓、硬膜外脓肿、化脓性颅内血栓性静脉炎的实验室诊断



注:AFB,抗酸杆菌;BCYE,缓冲炭酵母提取液,NAAT,核酸扩增试  验;RT,室温。

a结核病NAAT阴性不排除结核分枝杆菌

翻译:吕春宝 辽宁省抚顺市中心医院

审校评按:宁永忠 清华大学附属垂杨柳医院




表11




眼周结构感染/结膜炎、眶和眶周蜂窝织炎、泪腺和眼睑感染的实验室诊断



注:HSV,单纯疱疹病毒;NAAT,核酸扩增试验;RT,室温; VZV, 水痘-带状疱疹病毒。


a:沙眼衣原体的检测在美国尚未批准用于结膜拭子标本。不过独立实验室可能有有效的NAATs,适用于检查结膜炎患者的标本;研究表明,NAATs比培养更敏感。


b:使用NAAT检测沙眼衣原体,认为是超说明书(off label)使用。提供这种测试的实验室,必须在提供NAAT作为诊断测试之前对这些测试进行内部验证。


c:对于认为有B型疱疹病毒(灵长类起源)的标本进行培养时,需要在生物安全4级的实验室进行培养,试验通常要交给专门的参考实验室。当怀疑有B型疱疹病毒时,请咨询实验室。

翻译:吕春宝 辽宁省抚顺市中心医院

审校评按:宁永忠 清华大学附属垂杨柳医院




表12




 眼周结构感染或角膜炎的实验室诊断



注:AFB,抗酸杆菌;BCYE,缓冲炭酵母提取液;HSV,单纯疱疹病毒;KOH,氢氧化钾;NAAT,核酸扩增试验;RT,室温;VZV,水痘带状疱疹病毒。


a:特定病原的相对可能性,取决于角膜炎发展的根本原因。


b:将直接在患者床旁上获取的角膜刮取物材料,立即以Kimura刮刀直接接种在培养皿上,包括羊血琼脂平板和巧克力琼脂平板。通常以若干小的“C”形方式接种琼脂表面。如果有足够的样本,则在接种平板后,也可以在患者的床旁准备载玻片涂片。然后将接种的平板和载玻片(如果有)直接运送到微生物学实验室。


c:当怀疑诺卡菌属某些种时,应通知实验室,以便延长孵育培养时间,从而提高这种生长缓慢的微生物的分离率。其他平皿,如BCYE,可以提高诺卡菌的分离率。


d:角膜所有的术后感染均应进行快速抗酸涂片(染色)和分枝杆菌培养。此类病例,龟分枝杆菌是最常见。


e:在获得角膜刮取物时,至少应床旁接种一个含有非选择性真菌培养基的培养皿或斜面。如果有足够的样本,也可准备床旁载玻片涂片。只有在接种了平板/斜面后才能尝试这种方法。然后将接种的平板/斜面和载玻片(如果制备的话)直接运送到微生物学实验室。涂片在实验室中用钙荧光白染色并检查真菌成分。


f:角膜拭子标本常床旁接种非营养素琼脂平板,然后立即运送到实验室。在实验室孵育之前,将平板覆盖一层活的大肠埃希菌或肠杆菌科的其他种(即,共培养)的菌苔。或者,将接种有细菌的平板接种一块角膜刮取物或一滴用无菌盐水配置的刮取物悬浮液。

翻译:余霞 重庆市丰都县人民医院检验科

审校:王鹏 湖北省宜昌市中心医院

审校评按:宁永忠 清华大学附属垂杨柳医院




表13




眼内炎的实验室诊断



缩写:AFB,抗酸杆菌;BCYE,缓冲炭酵母提取液;KOH,氢氧化钾;室温,室温。 


a:在眼内炎的病原菌列表中,无乳链球菌、单核细胞增生李斯特菌和脑膜炎奈瑟菌是内源性感染最常见病因。其他所列细菌可能是导致继发于创伤或手术的眼内炎或血行播散所致的眼内炎的病原菌。


b:培养皿,包括羊血琼脂平板和巧克力琼脂平板,应在获得角膜刮取物时直接床旁接种(见表12的脚注“b”)。如果有足够的样品,在接种平板后,也可以在患者床旁准备载玻片涂片。然后将接种的平板和载玻片(如果有)直接运送到微生物学实验室。


c:怀疑诺卡菌属某些种时应通知实验室,以便使用特殊培养基,并将培养皿延长培养至7天。


d:眼内感染分离率最高分枝杆菌是龟分枝杆菌,几乎都是外科手术的并发症。


e:眼部的所有术后感染都应进行快速抗酸涂片和分枝杆菌培养。床旁接种7H-11琼脂或Lowenstein-Jensen琼脂斜面。如果有足够的临床样本,则应准备涂片。斜面和涂片(如果准备好的话)应直接运送到实验室进行进一步处理。如果在接种斜面并在床旁准备涂片后,仍有未使用的样本,则应将其置于无菌容器中立即送到实验室,可接种肉汤培养基,然后进行仪器检测。


f:所列真菌中,白念珠菌,光滑念珠菌和念珠菌属其他某些种,是由血行性播散而引起内源性眼内炎。其他所列真菌通常由于眼部外伤导致感染。


g:当获得角膜刮取物时,床旁直接接种至少一个含有非选择性真菌培养基的培养皿或斜面。如果可获得足够的样品,则在接种平板/斜面后,也可在床旁准备载玻片涂片。然后将接种的平板/斜面和载玻片(如果制备的话)直接运送到微生物学实验室。涂片在实验室中用钙荧光白染色以检查真菌组分。

翻译:余霞 重庆市丰都县人民医院检验科

审校:王鹏 湖北省宜昌市中心医院

审校评按:宁永忠 清华大学附属垂杨柳医院



表14



牙源性和口咽部菌群引起的口腔及相邻腔隙和组织感染的实验室诊断



缩写:AFB,抗酸杆菌;EDTA,乙二胺四乙酸;H&E,苏木精和伊红;KOH,氢氧化钾;NAAT,核酸扩增试验;RT,室温。

a:警告!有风险。采集标本过程中,可能会发生气道损害,必须有插管、复苏设备和在场人员。


b医务人员决定是否进行血培养。


c:注意,通常本地不一定能进行核酸检测,必须送到参考实验室,因此需要更长的周转时间。


d:如果要求巴通体培养,应提醒实验室,以便在样品到达实验室时可获得合适的培养基;即便如此,巴通体培养检出率也非常低。如果条件许可,巴通体核酸检测更敏感。应将部分标本送至组织病理学实验室进行H&E和Warthin-Starry染色。

翻译:余霞 重庆市丰都县人民医院检验科

审校:王鹏 湖北省宜昌市中心医院

审校评按:宁永忠 清华大学附属垂杨柳医院



表15



口咽源性和外源性病原所致乳突炎和恶性外耳炎的实验室诊断



缩写:AFB,抗酸杆菌;RT,室温

翻译:宁永忠 清华大学附属垂杨柳医院



表16


中耳炎的实验室诊断


翻译:宁永忠 清华大学附属垂杨柳医院



表17



鼻窦炎的实验室诊断



缩写:KOH,氢氧化钾;RT,室温。

a :金黄色葡萄球菌和化脓链球菌会导致急性上颌窦鼻窦炎,但不常见。

b :鼻窦穿刺(Antral puncture)是上颌窦鼻窦炎取材的有效方法。

c: 厌氧菌转运装置适用于需氧菌和厌氧菌。

翻译:梁金花 牡丹江医学院附属红旗医院

审校:王鹏 湖北省宜昌市中心医院

审校评按:宁永忠 清华大学附属垂杨柳医院



表18


咽炎的实验室诊断



缩写:CMV,巨细胞病毒;EBV,EB病毒;HIV,人类免疫缺陷病毒;HSV,单纯疱疹病毒;IgG,免疫球蛋白G;IgM,免疫球蛋白M;NAAT,核酸扩增试验;RT,室温。


a :化脓链球菌快速抗原检查可由医护人员在床边接种或转运到实验室完成检测。直接抗原检查有若干商品化试剂盒。其敏感性、可操作性各不相同。有些特殊检查需要拭子转运系统。儿科患者如果直接抗原检查阴性,且所用检查敏感性<80%,则需要送检第二个咽拭子标本进行更为敏感的NAAT或培养,二者是判断直接抗原检查结果假阴性可能性的试验。成年人通常不需要第二个检查。为便于儿科患者化脓链球菌检查2步法流程的顺利实施,一开始就要取双份拭子标本,如果直接抗原检查阳性,则弃去第二个拭子。


b :化脓链球菌直接NAAT比直接抗原检查敏感性高,阴性NAAT结果不必二次试验。拭子转运装置要和NAAT相配套。核酸探针检查通常用于增菌肉汤培养,需要的周转时间更长。

c :C群、G群β溶血链球菌通过培养进行检测,适用于需要了解此类分离株致病性地位的患者。只需要鉴定大菌落,因为有C群、G群抗原的小菌落是咽峡炎链球菌群(“米勒链球菌”)。咨询实验室以确定这些微生物是否可以常规筛检。


d: 溶血隐秘杆菌、淋病奈瑟菌、白喉棒杆菌仅仅在特定流行病学背景中才是咽炎病原体。对咽拭子标本实验室不必常规检查这些微生物。如果临床怀疑存在这些病原菌,告知实验室,以便采取恰当的方法


e :目前,在实验室咽部标本应用NAAT的方法检测淋病奈瑟菌是超说明书(off-label)应用,但可能有效。


f: 如果单点试验(Monospot test)阳性,考虑可能EBV感染。不过有10%是假阴性。假阴性可出现于任何年龄,但小儿更容易出现假阴性。有强烈临床提示为EBV感染时,单点试验阴性后要进行EBV特异性血清学检查以确定诊断。可以与单点试验使用同一标本。替代方式是,7~10d后重复血清标本单点试验,如果患者真是EBV感染,单点试验很可能是阳性的。参见第十四部分病毒诊断。


g :它仅仅是免疫功能受损患者的可能病原。已有若干快速试验可以检测临床标本中的HSV特异性抗原(通过直接荧光抗体);不过,非特异性的Tzanck 染色检查不够敏感,不予推荐。可以用拭子在多个咽损伤部位的基底部积极地采集样本,置于和后续试验配套的拭子转运装置中。免疫功能受损患者培养可能是有用的。


h: HSV血清学检测主要用于免疫状态和暴露状态检测,不再推荐IgM血清学检测。宁按:此处注释和上一版差别很大。而明言不推荐,表中却有列出,似乎矛盾。


翻译:梁金花 牡丹江医学院附属红旗医院

审校:王鹏 湖北省宜昌市中心医院

审校评按:宁永忠 清华大学附属垂杨柳医院


审稿:鲁炳怀 中日友好医院

         宁永忠 清华大学附属垂杨柳医院

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