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【杂谈】WHONET软件使用体会分享

2019-09-04 10:47

作者 陈轼

WHONET软件是WHO开发的一款数据库软件,是微生物检验工作者非常熟悉的统计软件,尤其是做耐药监测、院感统计时,它是必备工具。笔者自2003年开始接触WHONET软件,经历了从手工输入数据到自动转换,从单独进行本医院监测到参加省、部级的耐药监测使用,从统计本院数据到进行区域性数据统计,从一些三甲大医院普及到各等级医院,昔日王谢堂前燕飞入了寻常百姓家。在此,我想把十多年来自己在使用WHONET软件过程中的一些体会和各位老师共同分享一下,不足之处,敬请指教。


1.用途及优点

1.1. 对微生物的分离率、药敏情况进行统计,指导抗菌药物的规范化使用。

1.2. 进行本院的耐药监测,参与省市级或全国性耐药监测网。

1.3. 对不同实验室之间的数据进行整合,进行区域性耐药监测统计。

1.4. 进行有针对性的院感统计。

1.5. 所有统计均可选择是否按一定规则自动剔除重复菌株。


2.数据录入方式:

2.1.手工输入:繁琐、易错。(早期,基本淘汰)

2.2.LIS系统直接导出符合WHONET格式、代码要求的dBase、EXCEL等文件。(格式固定,更新不易)

2.3.LIS系统导出固定格式的TXT文件,再用BacLink软件进行转换。(格式灵活,更新方便)

2.3.1.我科室采用的导出TXT文件格式

2.3.1.1.第一行为标题行,用于与WHONET内部项目进行匹配。

2.3.1.2.样本资料(包括病人信息和结果信息)采用分行式(多于一行)。

2.3.1.3.各个标题和具体样本数据之间采用半角逗号分隔。


3.BacLink配置注意

目前,只要与LIS工程师沟通得当,大部分医院LIS系统均能导出符合BacLink要求格式的文件。但是这也仅仅是符合基础的格式要求,让WHONET能够“收到”数据;如果想顺利、准确的转换,还需要在BacLink里将LIS系统的一些代码录入,这样才能让WHONET“认识”这些收到的数据。

BacLink已经有一些默认设置,但是不一定符合各个医院自己的要求,那么在哪些地方可能需要改动呢?

3.1. 文件结构

3.1.1.设置抗生素

3.1.1.1. 默认的抗生素试验方法是需要自行按实际情况勾选。

3.1.1.2. 增加自己医院LIS系统的代码,用半角逗号隔开。

3.1.2.数据字段

这里的抗生素试验方法、抗生素名称和抗生素结果一定要匹配准确,才能让KB、MICEtest的结果各回各家,不然一堆类似KB=0.5、MIC=25之类的结果会让你在统计时头疼不已。

3.2. 代码和日期

在这里,应增加本单位使用的仪器和LIS里各药敏和酶类试验结果对应的代码,并选择正确的日期格式,方便选择时间段统计。


4.WHONET统计注意

4.1.分析选项

4.1.1.试验解释里,默认不选中“联合纸片法、MIC和Etest结果”,如果做常规的耐药监测,建议勾选,否则统计时会将同一种抗菌药物的纸片法、MIC和Etest结果分开统计。
4.1.2.%RIS和直方图里,根据实际情况修改抑菌圈直径、MIC和Etest范围,可使得图表刻度范围更加合适。

4.2.

统计时是默认用菌株,即以菌株为单位,不剔除重复菌株。在做耐药性统计分析时建议改为“用病人”或“用时间间隔或耐药表型”,以剔除重复菌株,使统计结果更加准确。
4.3. 结果输出 

统计结果的输出除了默认的屏幕显示外,还可以选择直接生成其他格式的文档,方便数据的编辑和传输。


5.折点更新

每年初CLSI发布新一版的M100抗菌药物折点判断标准,王辉老师会为我们带来第一手的资料,各位老师也会尽量及时更新自己实验室仪器和LIS系统的折点,以保证结果的准确。那么WHONET如何更新或设置抗菌药物的折点呢?

在“修改实验室”-“抗生素设置”里,点击“折点”,即可对抗菌药物的折点按CLSI进行修改,或者增加一些专家共识的折点,如替加环素等。这里注意区别KB法和MIC法,并且可以设置某些特殊菌种的单独折点。

特别提醒:修改完毕后保存即可,千万不要去点“更新折点”,它会用系统默认的折点把修改过的折点覆盖,类似于还原数据,那前面的努力就全部归零了。

6.宏的使用

对于一些重复的常规统计,比如院感监测,完全可以利用WHONET的宏来完成,设置好统计条件后,保存为宏,定期执行一下即可得到数据。如果有条件更改,也可以直接编辑宏,修改相应条件后保存即可进行新的统计,而无需退回条件选择界面重新选择。


投稿:陈轼 杭州市第三人民医院

审阅杨青 浙江大学医学院附属第一医院

           曾吉 武汉市第四医院